大豆低聚糖的吸湿性和保湿性比蔗糖小，但优于果葡糖浆，水分活性接近蔗糖。大豆低聚糖能溶于低分子烯醇，但不溶于非极性有机溶剂，其稳定性较高，即使在140℃高温或在ChemicalbookpH3的酸性条件下加热，或经发酵处理，仍保持其稳定性。此外大豆低聚糖的甜度较低，为蔗糖的70%，其热能是8.36kJ/g，仅是蔗糖热能的1/2。